Tại Philippines, hơn 41.000 người đã phải sơ tán. Bão đã làm 80 chuyến bay bị hủy và hàng nghìn phà chở khách bị kẹt tại cảng. Trung tâm thương mại của thành phố Cagayan de Oro trên đảo Mindanao bị ngập lụt do mưa to làm nước sông tràn bờ. Nhiều trường học phải đóng cửa. Do hậu quả tàn phá nghiêm trọng của cơn bão này, PAGASA đã quyết định sẽ loại bỏ tên gọi Pablo trong danh mục tên bão trong khu vực.[4]

Bopha là cơn bão nhiệt đới mạnh nhất từng đổ bộ vào đảo Mindanao ở phía nam Philippines, bão mạnh cấp 5 siêu bão với sức gió 260 km/h). Sau khi ảnh hưởng đến Palau, Bopha đổ bộ vào đất liền Mindanao vào cuối ngày 3 tháng 12.